Comment bénéficier du crédit d’impôt recherche en tant que startup en amorçage ?

Le crédit d’impôt recherche (CIR) est l’un des dispositifs fiscaux les plus avantageux pour les startups technologiques. Il permet de récupérer jusqu’à 30 % des dépenses de R&D, même en cas d’absence de chiffre d’affaires. Pourtant, beaucoup d’entrepreneurs pensent à tort que ce dispositif n’est accessible qu’aux structures matures ou déjà rentables.

En réalité, une startup en amorçage peut parfaitement bénéficier du CIR dès la première année, à condition de respecter certains critères et de bien structurer son dossier. Dans cet article, on vous explique comment obtenir le crédit d’impôt recherche dès les débuts de votre startup, avec des conseils concrets pour éviter les erreurs courantes.

Le crédit d’impôt recherche : rappel du fonctionnement

Le CIR est un avantage fiscal destiné à encourager les entreprises à investir dans la recherche et le développement. Il prend la forme d’un crédit d’impôt sur les sociétés, calculé sur la base des dépenses R&D engagées au cours de l’année.

Montant du crédit

• 30 % des dépenses R&D jusqu’à 100 millions d’euros

• 5 % au-delà (peu concerné en startup)

• Crédit imputable sur l’impôt sur les sociétés

• Si la société n’est pas imposable (cas d’une startup early stage), le crédit est remboursé en cash dans un délai de quelques mois

Oui, même sans chiffre d’affaires, vous pouvez obtenir un remboursement direct du CIR, ce qui en fait une source de financement non dilutive très précieuse.

Startup en amorçage : êtes-vous éligible au CIR ?

Pas besoin d’avoir un produit fini

Le CIR concerne les travaux de conception, de développement, d’expérimentation. Vous êtes donc éligible dès lors que vous travaillez sur :

• Le développement d’un logiciel ou d’une API

• Une innovation technique ou scientifique

• Un nouveau procédé ou algorithme

• Une application inédite de technologies existantes

Ce qui compte, c’est que vos travaux répondent à une incertitude technique et nécessitent un vrai effort de recherche ou d'ingénierie.

Les critères officiels d’éligibilité

Pour qu’un projet soit éligible au CIR, il doit répondre à trois critères définis par le ministère de la Recherche :

• Avancée scientifique ou technique : le projet dépasse l’état de l’art connu

• Incertitude technique : l’issue du développement ne peut être prédite à l’avance

• Méthodologie rigoureuse : documentation, hypothèses, tests, itérations

Le statut juridique importe peu, mais…

Le CIR est ouvert à toutes les sociétés imposées selon un régime réel (IS ou IR), quelle que soit leur forme (SAS, SASU, SARL…). Le plus important est :

• D’être immatriculé

• D’avoir engagé des dépenses R&D identifiables et traçables

👉 Si vous êtes encore en phase de structuration, trouver un associé via Cofondateur.fr peut vous permettre de consolider une équipe technique capable de porter un projet éligible au CIR. Cela augmente fortement la crédibilité de votre dossier.

Quelles dépenses peuvent être prises en compte dans le CIR ?

Voici les principales dépenses éligibles au crédit d’impôt recherche pour une startup en amorçage :

1. Salaires des développeurs ou ingénieurs

• Rémunérations brutes des personnes directement impliquées dans la R&D

• Charges sociales associées

• Prime de brevet (si existante)

À noter : les fondateurs rémunérés peuvent inclure leur propre salaire s’ils sont impliqués dans les travaux R&D.

2. Dépenses de sous-traitance

• Prestataires techniques ou freelances (dans la limite de 3 fois les dépenses internes)

• Centres de recherche publics ou agréés

Attention : pour être éligibles, les prestataires doivent être situés dans l’Union européenne et agréés CIR si ce sont des sociétés privées.

3. Dotations aux amortissements

• Matériel informatique ou équipements utilisés pour la R&D

• Serveurs, stations de travail, logiciels spécialisés

4. Dépenses de fonctionnement

Un forfait de 43 % des salaires R&D est automatiquement ajouté aux dépenses prises en compte, au titre des charges indirectes (électricité, locaux, etc.). Pour plus de détails sur les dépenses réellement éligibles, consultez notre article dédié. Enfin, n'oubliez pas de voir comment éviter un redressement fiscal lié au CIR pour garantir la sécurité de votre startup.

Comment déposer une demande de CIR en tant que jeune startup ?

1. Tenir une comptabilité rigoureuse

Même sans expert-comptable en interne, vous devez pouvoir :

• Distinguer clairement les dépenses R&D des autres dépenses

• Justifier les temps passés sur les tâches éligibles (fiches de temps, trello, rapports, etc.)

• Suivre les dépenses par projet ou par sprint

2. Constituer un dossier justificatif solide

Ce dossier n’est pas obligatoire au moment de la déclaration, mais il est indispensable en cas de contrôle. Il doit contenir :

• Une description technique des travaux R&D

• Les problématiques rencontrées

• Les étapes du développement

• Les personnes impliquées

• Les éléments d’incertitude et de recherche

Une startup qui n’a pas encore de produit finalisé peut tout à fait justifier de travaux R&D, à condition d’en garder la trace structurée.

3. Remplir la déclaration fiscale

Vous devrez compléter :

• Le formulaire CERFA n°2069-A-SD

• Et l’annexe technique (à fournir sur demande en cas de contrôle)

La déclaration se fait via votre espace professionnel sur impots.gouv.fr, généralement lors du dépôt de votre liasse fiscale annuelle.

👉 Vous pouvez vous faire accompagner par un cabinet spécialisé en CIR. Certains fonctionnent au succès, ce qui est intéressant pour une jeune startup à budget limité.

Les erreurs fréquentes à éviter

❌ Penser qu’il faut avoir du chiffre d’affaires

Le CIR est indépendant des revenus. Ce qui compte, c’est le niveau d’investissement R&D.

❌ Sous-estimer l’importance du dossier justificatif

En cas de contrôle fiscal, si vous ne pouvez pas justifier vos travaux, le remboursement peut être annulé. Un bon dossier technique est indispensable.

❌ Ne pas séparer les activités R&D et commerciales

Si vos développeurs font à la fois du code R&D et du code “classique” (intégration, maintenance…), vous devez bien distinguer les temps passés.

Conclusion : le CIR, un levier stratégique dès l’amorçage

Le crédit d’impôt recherche est un dispositif très avantageux, même pour une startup en amorçage sans revenus. Il permet de financer jusqu’à 30 % des efforts R&D dès les premiers mois d’activité, sous forme de remboursement.

Mais pour en bénéficier pleinement, il faut :

• Structurer votre projet de façon rigoureuse

• Construire une équipe technique crédible

• Justifier précisément les travaux menés

👉 Avant même de penser à déclarer votre CIR, entourez-vous des bons profils. Sur Cofondateur.fr, vous pouvez rencontrer un associé tech ou produit avec qui co-construire un projet R&D solide et éligible — et ainsi sécuriser vos premiers financements.

Pour des informations plus détaillées, consultez notre article sur CIR et recrutement : puis-je intégrer les salaires de mes développeurs dans le crédit d’impôt ? et découvrez comment articuler Crédit d’Impôt Recherche et statut JEI sans erreur.